活性肽在生物體內作為載體和運輸工具，將人們平常所食的營養輸送到人體各個部位，充分發揮其功能；小肽在生物體內作為神經遞質，傳遞信息；小肽具有極強的活性和多樣性，可全面調節人體生理功能，增強人體生理活性；肽不僅能提供人體生長發育所需的營養物質，而且具有特殊的生物學功能，可防治血栓、高血脂、高血壓，延緩衰老，抗疲勞，提高機體免疫力，促進人體對蛋白質、維生素、氨基酸、鈣、鐵、鋅、硒、鎂、銅等多種對人體有益微量元素的吸收；有些小肽具有原食品蛋白質或其他組成氨基酸所沒有的重要的生理機能。

生物活性肽中有些分子量較小的小肽，與氨基酸運輸功能相比，生物活性肽中的小肽具有吸收快速、低耗和不飽和的特點。

科學界和醫學界可利用其特點為一些特殊狀況下的人群補充營養，如術后傷口愈合期、康復期、身體復原期；精神壓力大，過度勞累，食欲不振；食物中化學物質、重金屬、輻射儲存、殘留農藥，長服化學藥物、中藥余毒，消化系統損害引起的腸胃功能失調者；運動量大、體力勞動強度大須及時補充氮源，又不能增加腸胃功能負擔者；消化系統因疾患障礙不能進食者；消化器官未發育成熟的嬰幼兒，消化吸收功能開始衰退的老人。

生物活性肽中的小肽對人體中的乳酸菌、雙岐桿菌和酵母菌等多種有益維生物的生長有顯著促進作用，這對食物營養的消化吸收具有重要意義。

1、現代免疫新品：生物活性多肽（小肽），如“非典”中發揮重要作用的“三九蛋白肽”，具有強化人體免疫功能，起到過去肽類藥品對付現代病毒所取不到的功能。

它可抗菌、抗現代病毒，阻止SARS細胞進入人體后，可模仿病毒表面的蛋白質論斷，與病毒進行“競爭”，從而阻斷病毒感染細胞的途徑。

因此，這種多肽是現代病毒的克星，是現代免疫的上品。這種多肽還具有刺激巨噬細胞的吞噬能力，抑制腫瘤細胞生長的作用。

2、多肽中神經肽可起到鎮痛及調節人體情緒、呼吸、脈搏、體溫的作用，與普通鎮痛劑不同的是，它經過消化器官進入人體后無任何副作用。

3、降血壓肽，它是通過抑制ACE的活性來實現降壓功能，達到治療高血壓的目的。

4.有眾多其他功能的活性肽，包括“調脂肽”、“減肥肽”、“酪蛋白磷酸肽（CPPs）”、“降糖肽（促胰酶肽）”、“激素肽（生長激素釋放因子）”、“白蛋白胰島素增長肽”、“抗菌肽”、“抗癌肽（腫瘤細胞壞死因子、環己肽、環肽）”和“抗艾滋病肽”等，都可利用其功能，防治“現代病”。